药物可以改变机体对其他药物的吸收、分布、代谢和排泄过程（请参见给药和药物动力学）。

抑酸药（如 H2 受体阻断剂和质子泵抑制剂）可增加胃内 PH 值，减少某些药物（如抗真菌药酮康唑）的吸收。

肝脏中的某些酶可使多数药物分解失活（代谢）。一些药物可影响（激活或失活）肝脏酶系，从而加快或者减慢其他药物的代谢。例如，巴比妥类药物（例如苯巴比妥）通过增加肝酶活性，使抗凝血药华法林更快失活，因此在相同时间段服用时效果较差。相反，如红霉素和环丙沙星之类的药物通过降低酶系统的活性，可增加华法林的活性，带来出血风险。服用华法林的患者同时服用影响肝酶的药物时，医生应密切监测患者，调整华法林剂量以抵消这些效果。停用其他药物后，应重新调整华法林剂量。此外，还有许多药物也可影响肝酶活性。

香烟中的化学物质可以增加一些肝酶的活性。因此吸烟会降低一些药物的药效，如茶碱（扩张气管药物）。

有些药物会影响其它药物的肾清除率。例如，大剂量维生素 C 会增加尿的酸性，因而可以改变某些药物的排泄速率和活性。例如，排泄速率可以因酸性药物（例如阿司匹林）而降低，但可能因碱性药物（例如伪麻黄碱）而增加。

因为存在如此多的药物相互作用，所以当开更多药物或配发处方时，许多医生和药剂师会通过查询参考书和计算机软件程序来降低风险。许多药房的电脑系统可自动审核用药医嘱和处方，确定是否存在药物相互作用。

如何降低药物-药物相互作用的风险

服用新药（包括非处方药和膳食补充剂，如草药）前应咨询医生和药师。

保存正在服用的全部药物的清单。定期与医生或药剂师讨论这份清单。

保存全部疾病清单。定期与医生讨论这份清单。

选择能提供全面服务（包括检查可能的药物相互作用）并为患者保存完整用药记录的药房。在这家药房配发全部处方药。

了解全部所开药物的目的和作用。

了解药物可能产生的副作用。

了解服药方式、一天应该服药的时间以及是否能与其他药物同时服用。

与药剂师一起回顾非处方药使用情况。讨论出现的任何疾病和正在服用的任何处方药。

按照指示服药。

出现可能与服药有关的症状时要通知医生或药师。

如果在不止一个医生处就医，要确保每一个提供诊疗的医生都知道你正在服用的所有药物。